Система для высокопроизводительного секвенирования SURFSeq 5000

Система для высокопроизводительного секвенирования SURFSeq 5000 от GeneMind — это флагманский NGS-секвенатор 2-го поколения, созданный для масштабных геномных проектов. 

Устройство оснащено уникальной технологией SURF-seq™, которая объединяет генерацию кластеров ДНК, секвенирование синтезом с обратимыми терминаторами и детекцию флуоресценции в полностью автоматизированном режиме. 

С двумя проточными ячейками и рекордной производительностью 1200 Гб за запуск SURFSeq 5000 позволяет секвенировать до 8 полных геномов человека или 100 экзомов за один цикл. Благодаря функции параллельного запуска ячеек, вы можете инициировать новый проект, не дожидаясь завершения текущего, что сокращает время простоя. Встроенный сенсорный экран, мощное ПО с аппаратным ускорителем и поддержка длинных чтений (до 300 п.н.) делают эту систему идеальной для исследований, требующих высокой пропускной способности и точности (Q30 для 85% оснований).

Области применения

SURFSeq 5000 используется в:

• Полногеномном секвенировании (WGS) человека, животных и растений.
• Экзомном секвенировании (WES) для выявления редких мутаций.
• Транскриптомных исследованиях (RNA-seq) и метагеномном анализе (mNGS).
• Изучении метилирования ДНК (WGBS) и эпигенетических модификаций.
• Секвенировании единичных клеток и больших генетических панелей (5-10 Гб/образец).
• Крупномасштабных проектах в персонализированной медицине, онкологии и популяционной генетике.

Особенности

• Технология SURF-seq™: Автоматическая генерация кластеров, секвенирование и анализ данных без ручных операций.
• Две проточные ячейки:
  • FCM: 500 млн прочтений/ячейку.
  • FCH: 2000 млн прочтений/ячейку.
• Параллельный запуск: Независимая работа ячеек для непрерывной обработки образцов.
• Длинные чтения: Парноконцевые прочтения до 300 п.н. для сборки сложных геномов.
• Высокая точность: 85% оснований с точностью Q30 (99,9%).
• Масштабируемость: Поддержка библиотек TruSeq и Nextera.
• Компактный дизайн для высокой производительности: Габариты 1090×690×810 мм при мощности до 1200 Гб/запуск.

Преимущества

1. Рекордная производительность: 1200 Гб за 47 часов — решение для мегапроектов.
2. Экономия времени: Параллельный запуск ячеек сокращает сроки выполнения задач на 30-40%.
3. Универсальность: Подходит для WGS, WES, RNA-seq, метагеномики и эпигенетики.
4. Автоматизация: Минимизация ручного труда и риска ошибок.
5. Точность и глубина: Обнаружение низкочастотных вариантов и структурных изменений.
6. Интеграция: Совместимость с облачными платформами и LIMS-системами.

Функции

• Секвенирование синтезом: Использование четырех флуоресцентно меченых нуклеотидов с обратимыми терминаторами.
• Режимы работы: Одноконцевые (150 п.н.) и парноконцевые (300 п.н.) чтения.
• Аппаратный ускоритель: Встроенный модуль для быстрой обработки данных (анализ 1 Гб за 2 минуты).
• Сенсорный интерфейс: Управление запусками, мониторинг прогресса и настройка параметров в реальном времени.
• Пакетное секвенирование: Одновременная обработка до 4 образцов в ячейке.
• Бесперебойная работа: Источник ИБП и ПК с CPU Xeon, 128 ГБ ОЗУ, SSD/HDD-накопителями.

SURFSeq 5000 — это не просто секвенатор, а платформа для прорывных открытий в геномике. Его способность обрабатывать гигабазы данных с беспрецедентной скоростью и точностью делает его ключевым инструментом для научных центров, клиник и фармацевтических компаний, стремящихся к лидерству в эпоху персонализированной медицины.